Quiz: Que savez-vous sur le microbiote ?

Eh non !!! Les micro-organismes vivent principalement sous forme de communautés complexes nommées microbiotes. Un microbiote se constitue principalement de bactéries mais aussi d’archées, de champignons et de virus. Ils vivent en symbiose, une relation de bénéfices mutuels pour atteindre un état d’équilibre. Nous sommes entourés de microbiotes, ils sont présents dans le sol, l’eau, les aliments que nous mangeons. Ils sont même présents sur et dans notre corps !

Bravo !!! Les micro-organismes vivent principalement sous forme de communautés complexes nommées microbiotes. Un microbiote se constitue principalement de bactéries mais aussi d’archées, de champignons et de virus. Ils vivent en symbiose, une relation de bénéfices mutuels pour atteindre un état d’équilibre. Nous sommes entourés de microbiotes, ils sont présents dans le sol, l’eau, les aliments que nous mangeons. Ils sont même présents sur et dans notre corps !

Depuis notre naissance, nous vivons en symbiose, une relation gagnant/gagnant, avec les micro-organismes présents dans notre corps et plus particulièrement dans nos intestins : parmi eux, plus de 50 000 milliards de bactéries pesant environ 2kg! Autant de bactéries que de cellules humaines.

Le microbiote intestinal d’un individu en bonne santé contient environ 300 espèces microbiennes. Nous partageons tous un petit noyau d’espèces bactériennes que nous appelons métagénome commun. Pourtant chacun d’entre nous héberge une composition unique de microbiobes. Nous sommes en effet différents par les gènes, les espèces et l’écologie de nos microbiotes.

Nous sommes microbiens et vivons avec des microbiotes présents sur différentes parties de notre corps. Leur composition varie en fonction de leur emplacement. Il y a le microbiote cutané présent sur la peau de notre corps, le microbiote pulmonaire, le microbiote de l’estomac, le microbiote oral. Il en existe d’autres comme le microbiote présent dans les organes génitaux par exemple.

La co-existence, relation de symbiose, entre l’humain et le microbiote intestinal va s’établir à partir de la naissance et va se façonner dans la première dizaine année de vie pour devenir stable à l’âge adulte.

Le microbiote intestinal joue un rôle majeur dans les fonctions immunitaires, digestives, neurologiques et métaboliques. Il est essentiel à notre santé et notre bien-être. En contrepartie, les bactéries intestinales vont se nourrir des nutriments que nous ne pouvons pas assimiler.

La dysbiose est une relation symbiotique microbiote-humain altérée, engendrant une perte de la diversité bactérienne, une augmentation de bactéries pathogènes, une augmentation de la perméabilité de la barrière intestinale et un état inflammatoire. En d’autres termes, la dysbiose est un déséquilibre du microbiote intestinal qui favoriserait l’apparition de maladies chroniques. Aujourd’hui la science montre qu’un microbiote intestinal riche et diversifié est essentiel à notre santé. Au contraire, une réduction de la diversité et de la richesse microbienne dans l’intestin conduit à un état de déséquilibre ce qui a des répercussions sur notre santé. Certaines fonctions du corps se dérèglent, comme le système immunitaire. Une faible diversité microbienne a été associée à des problèmes de santé à court et à long terme, tels que les maladies intestinales, les allergies, le diabète, l’obésité, l’autisme, le cancer colorectal et la cirrhose…

Le mode de vie occidental (excès d’antibiotiques, alimentation pauvre en fibres, stress, polluants…) peut faire varier la composition du microbiote intestinal. Ces facteurs conduisent à la diminution de la diversité de nos bactéries intestinales, ce qui pourrait entraîner des risques pour la santé. Aujourd’hui, un déficit en fibres est reconnu dans les pays occidentaux, tant pour les adultes que pour les enfants. Ce déficit a un impact sur la structure du microbiote intestinal, certaines bactéries du microbiote intestinal ont en effet tendance à disparaître. L’augmentation croissante des maladies inflammatoires et métaboliques liées au microbiote intestinal suggère que ces bactéries en déclin seraient nécessaires au maintien de notre santé.

Notre alimentation est un levier de première ligne. La façon dont nous mangeons impacte notre microbiote intestinal et notre corps. Plus la composante végétale de notre alimentation est variée et « saine », plus notre microbiote est diversifié et capable de nous protéger des bactéries pathogènes, des infections virales et autres maladies. En mangeant, nous nourrissons la symbiose et il est important d’apporter l’énergie au microbiote intestinal via les fibres alimentaires par exemple. Les probiotiques, les aliments fermentés et les aliments riches en polyphénols et une activité sportive régulière sont également des alliés pour le microbiote intestinal. Préserver cette symbiose c'est agir pour notre santé et notre bien-être !

Pour savoir quels sont les micro-organismes présents dans notre microbiote intestinal et en quelle quantité, un échantillon de selles devra être analysé par la métagénomique. La métagénomique est une technique moderne de génomique permettant l’étude des micro-organismes directement dans leur environnement naturel, en contournant la nécessité de les isoler et de les cultiver en laboratoire. Plusieurs étapes seront nécessaires : extraire l’ADN des bactéries présentes dans l’échantillon, lire ces fragments d’ADN en les séquençant, puis comparer les séquences obtenues à celles déjà listées dans une base de données afin de définir quelle bactérie est présente et en quelle quantité. Un volume considérable de données informatiques est ainsi généré et analysé !

Notre alimentation est un levier de première ligne. La façon dont nous mangeons impacte notre microbiote intestinal et notre corps. Plus la composante végétale de notre alimentation est variée et « saine », plus notre microbiote est diversifié et capable de nous protéger des bactéries pathogènes, des infections virales et autres maladies. En mangeant, nous nourrissons la symbiose et il est important d’apporter l’énergie au microbiote intestinal via les fibres alimentaires par exemple. Les probiotiques, les aliments fermentés et les aliments riches en polyphénols et une activité sportive régulière sont également des alliés pour le microbiote intestinal. Préserver cette symbiose c'est agir pour notre santé et notre bien-être !